顾名思义双开门杀菌锅就是两侧开门的杀菌锅。常规的杀菌锅都是一侧开门的，生的物料，或者说没有杀菌的物料都是从杀菌锅前端推进杀菌锅，杀菌完毕还是从杀菌锅的前端出来。
很多产品杀菌前后从感官上是看不出来的，比如说饮料。为了杜绝在周转过程中没有杀菌的产品被误判成杀过菌的产品流入下一个环节，有些用户选用双开门的杀菌锅。没有杀菌的产品只能从前门进，杀过菌的产品只能从后门出，中间用墙间隔开，作为生熟料的分界线。
双开门的杀菌锅还有一个功能，就是让杀菌工作实现自动流水线作业。装好筐的产品沿着输送线进到杀菌锅内，杀完菌后产品从后门出锅沿着流水线进入卸笼机。流水线作业大大提高自动化程度。
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