系统运行时，物料由泵抽出平衡罐，经二次蒸汽加热的管壳式换热器和直接蒸汽加热的管壳式换热器预热至75~78℃，然后由泵加压至0.6MPa左右，进入蒸汽喷射加热器。同时，压力为1MPa的蒸汽喷入料液中，料液瞬间升温至150℃，保温2秒钟。然后进料液体在真空下进入闪蒸罐，由于压力突然下降，其中的水含量急剧增加。料液迅速升温至77~78℃。从闪蒸罐蒸发的二次蒸汽分别流入管壳式换热器和冷凝器，流经换热器的二次蒸汽冷凝并通过与冷料液的热交换排出。进入凝汽器的二次蒸汽由凝汽器内的冷却水冷凝排出，不可凝汽由真空泵抽走。灭菌后的料液收集在闪蒸罐底部，并保持在一定水平。灭菌后的料液通过无菌泵送到均化器进行均化。均质材料进入冷却器进一步冷却后，被送到无菌罐或无菌灌装机进行灌装。
