由热源装置产生的热量对热交换器中的水进行加热，当水温达到食品冻干所需要的温度时，启动热水泵对加热板加热。热水在加热板中经过循环后返回热交换器中经再加热循环，为升华干燥和迁移干燥提供足够的升华热。解析干燥时，加热温度在保证不使食品过热变性的前提下予以提高，使水分迅速地从吸附中解析出来。全部干燥过程结束时，加热系统切换至冷却系统,对加热板进行冷却，保证下一次干燥时加热板温度尽可能低。此外，冷却系统还用于紧急冷却。应急冷水冷却系统包括冷却水塔、循环水泵、热交换器、管道阀门、控制装置等。用于冷冻干燥期间干燥室压力升高，接近崩解温度时实行紧急冷却，降低加热板温度，避免产品报废。
