圆筒式分子蒸馏器
材料以真空状态放入缸内，用加热器加热，凝结成冷凝器。该装置构造简洁，操作便捷，但蒸发面不移动，液层无法更新，蒸馏持续加热，热分解容易，效率低，不适合热不稳定物料蒸馏。
降膜式分子蒸馏器
该装置的冷凝表层和蒸发表层为两个同心圆柱，材料在重力作用下沿蒸发表层流动，形成连续更新的液膜。但是，液膜受流量和粘度的影响，厚度不均匀，无法完全复盖蒸发面，影响了有效面积的蒸发率:同时加热时间长，塔顶至塔底的压力损失大，蒸馏温度升高，热不稳定的物质适用范围有限。
刮膜式分子蒸馏器
该装置改善了薄膜还原分子蒸馏器的缺点,在蒸馏器中设置了旋转刮刀,将材料迅速、均匀、连续地剥离成液膜。进入到蒸发器底部，不挥发组件从出口流出的残渣；不凝气体从真空流出。该装置能有效地控制薄膜厚度和均匀性，通过刮刀的转速也能控制材料的停留时间，提高蒸发效率，降低热分解，可用于蒸发介质热敏性物质。其构造简洁，易于制造，操作参数比较容易控制，维修便捷，是目前适用范围最广、特性比较完整的一种分子蒸馏器。
离心式分子蒸馏器
该装置的蒸发器是一个高速旋转锥形容器，材料从底部进入，通过旋转表层的离心力覆盖整个蒸发表层，形成一个连续更新的均匀厚度液膜。蒸发器在蒸发表层停留时间短（0.05～1.5s），凝结在相反的冷凝表层，出水从锥形冷凝器底部抽取，残渣从蒸发表层外缘通道数据采集，蒸发表层与冷凝表层之间的距离可调，形成的液膜非常薄（一般为0.01～0.1mm），蒸馏效率高，分离效果好。是现代最有效的分子蒸馏装置，适用于各种原料的蒸馏。但其结构复杂，维修困难，成本很高。
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